Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HIF1AQ16665 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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