Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFLP07196 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEFLP07196 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEFLP07196 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEFLP07196 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEFLP07196 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEFLP07196 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms