Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TK1P04183 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TK1P04183 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TK1P04183 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TK1P04183 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.1 ms