Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2E1P29083 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms