Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCSO14618 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCSO14618 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCSO14618 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCSO14618 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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