Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GTF3C3Q9Y5Q9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GTF3C3Q9Y5Q9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GTF3C3Q9Y5Q9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms