Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHTF1Q9UMS5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHTF1Q9UMS5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PHTF1Q9UMS5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHTF1Q9UMS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHTF1Q9UMS5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 617.3 ms