Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBLCQ9ULV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLCQ9ULV8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLCQ9ULV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBLCQ9ULV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms