Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC3Q9UHC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC3Q9UHC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC3Q9UHC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ASIC3Q9UHC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC3Q9UHC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms