Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ING3Q9NXR8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ING3Q9NXR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms