Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A12Q9NXJ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A12Q9NXJ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A12Q9NXJ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms