Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX15Q9NRS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX15Q9NRS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX15Q9NRS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX15Q9NRS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX15Q9NRS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX15Q9NRS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms