Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BATF3Q9NR55 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BATF3Q9NR55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BATF3Q9NR55 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BATF3Q9NR55 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms