Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4BQ9NPR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4BQ9NPR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4BQ9NPR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms