Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SARS2Q9NP81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARS2Q9NP81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SARS2Q9NP81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARS2Q9NP81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms