Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
XAB2Q9HCS7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
XAB2Q9HCS7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XAB2Q9HCS7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XAB2Q9HCS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XAB2Q9HCS7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms