Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFRA4Q9GZZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GFRA4Q9GZZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GFRA4Q9GZZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GFRA4Q9GZZ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GFRA4Q9GZZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms