Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCLK3Q9C098 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DCLK3Q9C098 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DCLK3Q9C098 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCLK3Q9C098 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms