Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A1Q9BZW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC13A1Q9BZW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC13A1Q9BZW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC13A1Q9BZW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms