Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNN2Q99439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNN2Q99439 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNN2Q99439 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms