Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERGIC2Q96RQ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERGIC2Q96RQ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERGIC2Q96RQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERGIC2Q96RQ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERGIC2Q96RQ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms