Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM46AQ96IP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM46AQ96IP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM46AQ96IP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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