Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC34Q96HJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC34Q96HJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC34Q96HJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC34Q96HJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC34Q96HJ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms