Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF21BQ96EK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF21BQ96EK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF21BQ96EK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF21BQ96EK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms