Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM44Q96DX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM44Q96DX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM44Q96DX7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM44Q96DX7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM44Q96DX7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms