Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC39Q96DD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC39Q96DD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC39Q96DD0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC39Q96DD0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms