Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM239Q8WW34 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM239Q8WW34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM239Q8WW34 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM239Q8WW34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.7 ms