Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC29Q8WV35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC29Q8WV35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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LRRC29Q8WV35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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LRRC29Q8WV35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC29Q8WV35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC29Q8WV35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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