Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHPT1Q8WUD6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHPT1Q8WUD6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHPT1Q8WUD6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPT1Q8WUD6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms