Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYRIPQ8NFW9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYRIPQ8NFW9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MYRIPQ8NFW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYRIPQ8NFW9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYRIPQ8NFW9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms