Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC5Q8NAU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNDC5Q8NAU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC5Q8NAU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNDC5Q8NAU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms