Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNLDC1Q8NA58 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNLDC1Q8NA58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNLDC1Q8NA58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNLDC1Q8NA58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221 ms