Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC89Q8N998 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC89Q8N998 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC89Q8N998 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC89Q8N998 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC89Q8N998 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms