Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC18Q8N456 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC18Q8N456 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC18Q8N456 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC18Q8N456 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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