Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y46

KRT73, Keratin, type II cytoskeletal 73, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT73Q86Y46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT73Q86Y46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT73Q86Y46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT73Q86Y46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT73Q86Y46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms