Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF165Q6ZSG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF165Q6ZSG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF165Q6ZSG1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF165Q6ZSG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF165Q6ZSG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms