Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCIMPQ6UWF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCIMPQ6UWF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCIMPQ6UWF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms