Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC8BQ6P9F7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC8BQ6P9F7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC8BQ6P9F7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC8BQ6P9F7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms