Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
REEP3Q6NUK4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP3Q6NUK4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP3Q6NUK4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP3Q6NUK4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP3Q6NUK4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms