Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXB2Q5VYV0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXB2Q5VYV0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXB2Q5VYV0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms