Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP188Q5SRE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUP188Q5SRE5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NUP188Q5SRE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NUP188Q5SRE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NUP188Q5SRE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms