Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPANXN3Q5MJ09 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPANXN3Q5MJ09 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPANXN3Q5MJ09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPANXN3Q5MJ09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms