Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPANXN4Q5MJ08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN4Q5MJ08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPANXN4Q5MJ08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPANXN4Q5MJ08 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms