Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR38Q5JTN6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR38Q5JTN6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR38Q5JTN6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms