Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ME3Q16798 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ME3Q16798 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ME3Q16798 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ME3Q16798 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ME3Q16798 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ME3Q16798 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ME3Q16798 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ME3Q16798 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ME3Q16798 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ME3Q16798 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ME3Q16798 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ME3Q16798 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ME3Q16798 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ME3Q16798 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ME3Q16798 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ME3Q16798 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ME3Q16798 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ME3Q16798 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ME3Q16798 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ME3Q16798 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ME3Q16798 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ME3Q16798 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ME3Q16798 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ME3Q16798 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ME3Q16798 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ME3Q16798 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ME3Q16798 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ME3Q16798 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ME3Q16798 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ME3Q16798 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ME3Q16798 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ME3Q16798 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ME3Q16798 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ME3Q16798 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ME3Q16798 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ME3Q16798 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ME3Q16798 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ME3Q16798 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ME3Q16798 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ME3Q16798 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ME3Q16798 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ME3Q16798 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ME3Q16798 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ME3Q16798 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ME3Q16798 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ME3Q16798 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ME3Q16798 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ME3Q16798 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ME3Q16798 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ME3Q16798 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ME3Q16798 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ME3Q16798 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ME3Q16798 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ME3Q16798 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ME3Q16798 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ME3Q16798 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ME3Q16798 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ME3Q16798 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ME3Q16798 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ME3Q16798 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ME3Q16798 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ME3Q16798 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ME3Q16798 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ME3Q16798 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ME3Q16798 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ME3Q16798 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ME3Q16798 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ME3Q16798 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ME3Q16798 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ME3Q16798 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ME3Q16798 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ME3Q16798 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ME3Q16798 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ME3Q16798 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ME3Q16798 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ME3Q16798 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ME3Q16798 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ME3Q16798 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
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