Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCBQ16585 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCBQ16585 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCBQ16585 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCBQ16585 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms