Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC18A3Q16572 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC18A3Q16572 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A3Q16572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC18A3Q16572 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A3Q16572 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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