Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL19A1Q14993 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL19A1Q14993 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL19A1Q14993 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL19A1Q14993 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms