Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMAD4Q13485 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMAD4Q13485 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMAD4Q13485 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMAD4Q13485 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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