Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERCC8Q13216 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERCC8Q13216 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERCC8Q13216 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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